Komora trzonowego zęba to pole o wymianach 5 na 4 mm. Na tym obszarze znajduje się kilka ujść kanałów korzeniowych o przekroju ułamka milimetra, które trzeba odnaleźć, a następnie opracować i szczelnie wypełnić.

Często znalezienie kanałów jest możliwe wyłącznie pod powiększeniem. Mikroskop jest więc tutaj nieoceniony.

Za jego pomocą można zajrzeć do wnętrza kanałów korzeniowych, zlokalizować ewentualne przeszkody, udrożnić, usunąć złamane narzędzie, zamkną perforację. Dzięki temu często możemy zachować ząb, który przy tradycyjnym leczeniu byłby przeznaczony do usunięcia.